Peptido liburutegi motak

Alanine Scanning Liburutegia
    Ala eskaneatzeko peptidoen liburutegia sekuentzia batean aminoazido espezifikoen efektuak peptidoen funtzioan identifikatzeko metodo bat da. Sekuentzian ordezkatzen ditugu sekuentziako aminoazidoak Ala-rekin; Ala eskaneatzeko peptido liburutegiaren bidez, aminoazido espezifikoek proteina-egitura orokorrean, funtzioan eta beste jarduera biologikoetan duten eragina identifikatu daiteke.

Posizionala eskaneatzeko liburutegia (PSL)
    Posizionala eskaneatzeko peptido liburutegia tresna garrantzitsua da peptido-sekuentziak optimizatzeko. Sistematikoki beste aminoazido batzuk ordezkatzen ditu peptido baten eskualde edo gune hautatuak eta gune horietan aminoazido optimoak zehazten ditu peptidoen jarduera saiakuntzen bidez. Peptidoen liburutegi mota honek posizio zehatzetan eragin edo jarduera bereziak dituzten eskualde zehatzak identifikatzen laguntzen die ikerlariei.

Gainjarritako liburutegia

Gainjarritako peptido liburutegia epitopo linealak edo jarraituak bahetzeko metodo arrunta da. Peptidoen liburutegiaren diseinua bi parametrok zehazten dute nagusiki: peptidoaren luzera eta desplazamendu-zenbakia. Proteina N-muturretik C-muturrera moztuta dagoenez, baliteke amaieran peptido umezurtz bat uztea. Luzera koherentea mantentzeko, N-muturretik aminoazido bat edo batzuk aldatzea gomendatzen dugu.

Mozketaren peptidoen liburutegiak

Mozketaren peptidoen liburutegiak peptido-sekuentzia baten barruan aminoazidoen sekuentzia laburrenak identifikatzeko erabiltzen dira. Mozketaren peptidoen liburutegien eraikuntzak normalean jatorrizko peptido-sekuentziaren bi muturretatik aminoazidoak sistematikoki kentzea dakar. Zenbait aminoazido garrantzitsu ezagutzen badira, aminoazido horiek mantendu behar dira, eta, ondoren, aminoazidoak banan-banan kentzen dira peptidoaren beste muturretik baheketa hasteko.

Ausazko Peptidoen Liburutegia

Ausazko peptido liburutegiak 20 aminoazido naturalak barneratzeko eskopeta baten bidez diseinatuta daude, eta aldi berean hautatutako aminoazidoen hondakinak ausaz ordezkatzen dituzte.

Nahasitako liburutegia

Nahasitako liburutegien diseinua jatorrizko peptido aminoazidoen sekuentziaren barne berrantolaketetan oinarritzen da. Mutazio maila handiena duen peptido liburutegia da. Etenatutako peptidoak kontrol negatibo gisa erabiltzen dira sarritan, sekuentzia espezifikoak proteinen funtziorako edo jarduerarako funtsezkoak direla frogatzeko. Helburu berriak identifikatzeko erabiltzen den ausazko baheketa tresna ere bada.