Zer dira zelulak barneratzen dituzten peptidoak?

Zelula barneratzen diren peptidoak peptido txikiak dira, zelula-mintzean erraz sartzen direnak.Molekula-klase honek, bereziki bideratze-funtzioak dituzten CPPak, zeluletara botika eraginkorra emateko konpromisoa du.

Hori dela eta, horren inguruko ikerketak nolabaiteko garrantzia du biomedikuntza.Azterketa honetan, sekuentzia mailan mintzaz gaindiko jarduera desberdinak dituzten CPPak aztertu dira, CPPen mintzaz gaindiko jardueran eragina duten faktoreak, jarduera desberdinak dituzten CPPen eta NonCPPen arteko sekuentzia-desberdintasunak ezagutu nahian, eta sekuentzia biologikoak aztertzeko metodo bat sartuz.

CPPs eta NonCPPs sekuentziak CPPsite datu-basetik eta literatura ezberdinetatik lortu ziren, eta CPPs sekuentzietatik datu-multzoak eraikitzeko transmintz peptidoak (HCPP, MCPP, LCPP) transmintz-jarduera altua, ertaina eta baxua zuten.Datu multzo horietatik abiatuta, ikerketa hauek egin dira:

1, CPP eta NonCPP aktibo ezberdinen aminoazidoen eta egitura sekundarioaren konposizioa ANOVAren bidez aztertu zen.Aurkitu zen aminoazidoen interakzio elektrostatiko eta hidrofobikoek rol garrantzitsua izan zutela CPPen mintz-jardueran, eta egitura helikoidalak eta ausazko kiribiltzeak CPP-en mintz-jardueran ere eragina izan zuten.

2. Bi dimentsioko planoan bistaratu ziren jarduera desberdinak dituzten CPPen propietate fisiko eta kimikoak eta luzerak.Jarduera desberdinak dituzten CPPak eta NonCPPak propietate berezi batzuen azpian bildu zitezkeela aurkitu zen, eta HCPPak, MCPPak, LCPPak eta NonCPPak hiru multzotan banatu ziren, haien desberdintasunak erakutsiz;

3. Lan honetan, sekuentzia biologikoaren zentroide fisiko eta kimikoaren kontzeptua sartzen da, eta sekuentzia osatzen duten hondarrak partikula puntutzat hartzen dira, eta sekuentzia ikerketarako partikula-sistema gisa abstraitzen da.Metodo hau CPPen analisian aplikatu zen PCA metodoaren bidez jarduera desberdinak dituzten CPPak 3D planoan proiektatuz, eta CPP gehienak batera bilduta eta LCPP batzuk NonCPPekin batera bildu zirela ikusi zen.

Azterketa honek ondorioak ditu CPPen diseinuan eta jarduera ezberdinekin CPPen sekuentzien desberdintasunak ulertzeko.Horrez gain, lan honetan aurkeztutako sekuentzia biologikoen zentroide fisiko eta kimikoen analisi-metodoa beste arazo biologiko batzuk aztertzeko ere erabil daiteke.Aldi berean, sailkapen biologikoko arazo batzuetarako sarrera-parametro gisa erabil daitezke eta ereduak ezagutzeko zeregina izan dezakete.