Transmintz peptidoen egitura-ezaugarriak eta sailkapena

Mintzaz gaindiko peptido mota asko daude, eta haien sailkapena propietate fisiko eta kimikoetan, iturrietan, irensteko mekanismoetan eta aplikazio biomedikoetan oinarritzen da.Beren propietate fisiko eta kimikoen arabera, mintzean sartzen diren peptidoak hiru motatan bana daitezke: kationikoak, anfifiloak eta hidrofoboak.Mintz katioiko eta anfifiliko barneko peptidoek % 85 dira, eta mintz hidrofobikoek % 15 baino ez dute sartzen.

1. Mintz kationikoa peptido sarkorra

Transmintz-peptido katioikoak arginina, lisina eta histidinatan aberatsak diren peptido laburrez osatuta daude, hala nola TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 eta DPV6.Horien artean, argininak guanidina dauka, zelula-mintzean negatiboki kargatutako azido fosforikoko taldeekin hidrogenoa lotu daitekeela eta mintza-peptidoen bitartekaritza PH balio fisiologikoaren baldintzapean.Oligargininaren ikerketek (3 R-tik 12 R-ra) erakutsi zuten mintza sartzeko gaitasuna arginina-kopurua 8 bezain baxua zenean soilik lortzen zela, eta mintza-sartze-gaitasuna pixkanaka handitu zen arginina-kopurua handitzean.Lisinak, arginina bezalako katioiduna bada ere, ez du guanidinarik, beraz, bakarrik dagoenean, bere mintzaren sartze-eraginkortasuna ez da oso altua.Futaki et al.(2001) aurkitu zuten mintz-sartze-efektu ona lor zitekeela zelula katioikoen mintz barneko peptidoak gutxienez positiboki kargatutako 8 aminoazido zituenean.Nahiz eta positiboki kargatutako aminoazido-hondarrak ezinbestekoak diren peptido sarkorrak mintzean barneratzeko, beste aminoazido batzuk ere garrantzitsuak dira, adibidez, W14 F-n mutatzen denean, Penetratinaren sargarritasuna galtzen da.

Mintz transmintz peptido katioikoen klase berezi bat lokalizazio nuklearren sekuentziak (NLS) dira, arginina, lisina eta prolinan aberatsak diren peptido laburrez osatuta eta nukleora garraiatu daitezkeen poro-konplexu nuklearraren bidez.NLSak idazketa bakarrean eta bikoitzean bana daitezke, oinarrizko aminoazidoen multzo bat eta bi multzoz osatuta, hurrenez hurren.Esate baterako, PKKKRKV simia birusaren 40 (SV40) tipo bakarreko NLS bat da, proteina nuklearra, berriz, tipo bikoitzeko NLS bat.KRPAATKKAGQAKKKL mintz transmintzean zeregina izan dezakeen sekuentzia laburra da.NLS gehienek 8 baino karga-zenbakiak txikiagoak dituztenez, NLSak ez dira mintz transmintz peptido eraginkorrak, baina mintz transmintz peptido eraginkorrak izan daitezke peptido sekuentzia hidrofoboekin kobalenteki lotzen direnean, mintz transmintz peptido anfifilikoak eratzeko.

egitura-2

2. Transmintz-peptido anfifilikoa

Anfifiliko transmintz peptidoak domeinu hidrofiliko eta hidrofoboz osatuta daude, anfifilo primarioetan, α-helidal anfifiliko sekundarioetan, anfifiliko β-tolesgarrietan eta prolinaz aberastutako anfifilikoetan banatu daitezkeenak.

Lehen mailako higadura anfifilikoko mintz peptidoak bi kategoriatan, peptido sekuentzia hidrofobikoen bidez kobalenteki konektatuta dauden NLSak, hala nola MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) eta Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV). MPG-ren domeinua GIBaren 41 glikoproteinaren fusio-sekuentziarekin lotuta dago (GALFLGFLGAAGSTMG A), eta Pep-1-ren domeinu hidrofoboa mintz-afinitate handiko triptofano aberatseko multzoarekin (KETWWET WWTEW).Hala ere, bien domeinu hidrofoboak PKKKRKV lokalizazio nuklear seinalearekin lotuta daude WSQP bidez.Mintz transmintz-peptido anfifiliko nagusien beste klase bat proteina naturaletatik isolatu zen, hala nola pVEC, ARF(1-22) eta BPrPr(1-28).

Bigarren mailako α-helize anfifiliko transmintz peptidoak α-helizeen bidez mintzera lotzen dira, eta haien aminoazido-hondakin hidrofilo eta hidrofoboak egitura helikoidaleko gainazal ezberdinetan kokatzen dira, MAP (KLALKLALK ALKAALKLA) adibidez.Beta peptido tolestura motako higadura-mintz anfifilikorako, beta xafla pliestua osatzeko gaitasuna funtsezkoa da mintzaren barneratzeko gaitasunerako, esate baterako, VT5-n (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) mintzaren sartze-gaitasuna ikertzeko prozesuan, D motaren bidez. - Aminoazidoen mutazio analogoek ezin izan zuten beta tolestutako pieza osatu, mintzaren sartze-gaitasuna oso eskasa da.Prolinaz aberastutako anfifilo transmintz peptidoetan, poliprolina II (PPII) erraz sortzen da ur puruan prolina polipeptidoaren egituran oso aberastuta dagoenean.PPII ezkerreko helizea da, bira bakoitzeko 3,0 aminoazido-hondakin dituena, eskuineko alfa-helizearen egitura estandarraren aurka, bira bakoitzeko 3,6 aminoazido-hondakin dituena.Prolinaz aberastutako anfifilo transmintz peptidoek 7 (Bac7) peptido antimikrobiano behien artean, polipeptido sintetikoa (PPR)n (n 3, 4, 5 eta 6 izan daiteke), etab.

egitura-3

3. Mintz hidrofoboa peptido sarkorra

Transmintz-peptido hidrofoboek aminoazido-hondakin ez-polarrak baino ez dituzte, aminoazido-sekuentziaren karga osoaren % 20 baino gutxiagoko karga garbiarekin, edo transmintzetarako funtsezkoak diren zati hidrofoboak edo talde kimikoak dituzte.Sarritan zelula transmintz peptido hauek ahaztu egiten badira ere, existitzen dira, hala nola, fibroblastoen hazkuntza-faktorea (K-FGF) eta fibroblastoen hazkuntza-faktorea 12 (F-GF12) Kaposiren sarkomatik.


Argitalpenaren ordua: 2023-mar-19