Azalean, lotura peptidikoen eraketa, dipeptidoak emanez, prozesu kimiko sinple bat da.Horrek esan nahi du bi aminoazidoen osagaiak lotura peptidiko baten bidez, amidazko lotura baten bidez, lotuta daudela deshidratatzen diren bitartean.
Lotura peptidikoen eraketa aminoazido baten aktibazioa da erreakzio-baldintza leunetan.(A) karboxilo zatia, bigarren aminoazidoa (B) Aktibatutako karboxilo nukleofiliko zatiak dipeptidoa (AB) eratzen du orduan."Osagai karboxiloa (A) babestuta ez badago, ezin da lotura peptidikoaren eraketa kontrolatu".Peptido linealak eta ziklikoak bezalako azpiproduktuak AB helburuko konposatuekin nahas daitezke.Hori dela eta, lotura peptidikoaren eraketan parte hartzen ez duten talde funtzional guztiak aldi baterako modu itzulgarrian babestu behar dira peptidoen sintesian.
Beraz, peptidoen sintesiak - peptido-lotura bakoitzaren eraketak - agregazio-hiru urrats hartzen ditu.
Lehen urratsa babesa behar duten aminoazido batzuk prestatzea da, eta aminoazidoen egitura zwitterionikoa ez da existitzen.
Bigarren urratsa bi urratseko erreakzio bat da, lotura peptidikoak sortzeko, eta bertan N-babestutako aminoazidoaren karboxilo taldea aktibatzen da lehenik bitarteko aktibora eta gero lotura peptidikoa sortzen da.Akoplatutako erreakzio hau urrats bakarreko erreakzio gisa edo bi erreakzio sekuentzial gisa gerta daiteke.
Hirugarren urratsa babes-oinarria selektiboa kentzea edo erabat kentzea da.Kenketa guztiak peptido-kate guztiak muntatu ondoren bakarrik gerta daitezkeen arren, babes-taldeak selektiboa kentzea ere beharrezkoa da peptidoen sintesian jarraitzeko.
10 aminoazidok (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec eta Cys) albo-katearen talde funtzionalak dituztelako, babes selektiboa behar dutenez, peptidoen sintesia zailduz.Babes aldi baterako eta erdi-iraunkorreko oinarriak bereizi behar dira, selektibitatearen baldintza desberdinak direla eta.Aldi baterako babes-taldeak hurrengo urratsean erabiltzen dira aminoazidoen edo karboxilo-talde funtzionalen aldi baterako babesa islatzeko.Babes-talde erdi-iraunkorrak kentzen dira dagoeneko eratutako peptido-loturak edo albo-kate aminoazidoak oztopatu gabe, batzuetan sintesian.
"Egokiena, karboxilo-osagaiaren aktibazioa eta ondorengo lotura peptidikoen eraketa (akoplamendu-erreakzioak) azkarra izan behar da, arrazemiko edo azpiprodukturik gabe, eta erreaktibo molarrak aplikatu behar dira etekin handiak lortzeko".Zoritxarrez, akoplamendu kimikoko metodo batek ere ez ditu baldintza hauek betetzen, eta gutxi dira sintesi praktikorako egokiak.
Peptidoen sintesian zehar, hainbat erreakziotan parte hartzen duten talde funtzionalak eskuzko zentroarekin lotuta egon ohi dira, glizina da salbuespen bakarra, eta errotazio arriskua dago.
Peptidoen sintesi-zikloaren azken urratsa babes talde guztiak kentzea da.Babes-taldeak selektiboa kentzea garrantzitsua da peptido-katearen luzapenerako, dipeptidoen sintesian babes osoa kentzeko eskakizunaz gain.Estrategia sintetikoak arretaz planifikatu behar dira.Aukera estrategikoaren arabera, N-k α-amino edo karboxilo talde babesleak selektiboki ken ditzake."Estrategia" terminoak aminoazido indibidualen kondentsazio-erreakzioen sekuentziari egiten dio erreferentzia.Oro har, aldea dago pixkanakako sintesiaren eta zatien kondentsazioaren artean.Peptidoen sintesia («sintesi konbentzionala» izenez ere ezaguna) disoluzioan gertatzen da.Kasu gehienetan, kate peptidikoaren pixkanaka-pixkanaka luzatzea zati laburragoak sintetizatzeko kate peptidikoa erabiliz soilik sintetiza daiteke.Peptido luzeagoak sintetizatzeko, xede-molekulak zati egokietan segmentatu behar dira eta C muturrean diferentziazio-maila minimiza dezaketela zehaztu.Banakako zatiak pixkanaka muntatu ondoren, xede-konposatua elkartuko da.Peptidoen sintesiaren estrategiak babes-zatirik onena eta egokiena hautatzea barne hartzen du, eta peptidoen sintesiaren estrategiak babes-baseen konbinazio egokiena eta zati-konjugazio-metodo onena hautatzea barne hartzen du.
Argitalpenaren ordua: 2023-07-19