Peptido antimikrobiano horiek jatorriz intsektuen, ugaztunen, anfibioen eta abarren defentsa sistemetatik eratorriak ziren, eta batez ere lau kategoria daude:
1.. Cecropina jatorriz zekipiamotiko immunologikoan zegoen, batez ere, beste intsektu batzuetan aurkitzen dena, eta antzeko peptido antzekoak ere aurkitzen dira txerri hesteetan. Normalean, nm-terminal alkalino batek ezaugarri ditu, eta ondoren zati hidrofobo luzea da.
2. Xenopus antimikrobiako peptidoak (magaininak) igelen muskuluen eta urdailetik eratorria da. Xenopus antimikrobioen peptidoen egitura ere heliko izan da, batez ere ingurune hidrofoboetan. Lipidoen geruzetan xenopus antipeptidoak konfiguratzea NMR fase solidoak nmr-k aztertu zuen. Acilaminaren oihartzunaren aldaketa kimikoan oinarrituta, Xenopus antipeptidoen helizeak Bilayer gainazal paraleloak izan ziren eta 30mm-ko egitura heliko aldizkako batekin 13mm kaiola eratzeko konbergitu litezke.
3. Defensin Defense Peptidoak gizakien neutrofilo neutrofilo polykariotikoetatik eratorriak dira, lobulu nuklear osoarekin eta hesteetako animalien zelulekin. Mamiarteko defentsa peptidoen antzeko peptido antimikrobianoen multzoa intsektuetatik atera zen, "intsektu defentsa peptidoak" izenekoak. Mamiarteko defentsa peptidoak ez bezala, intsektuen defentsa peptidoak bakterio gramo positiboen aurka bakarrik daude. Intsektuen defentsa peptidoek sei CYS hondakin ditu, baina elkarren arteko lotura desplematzeko metodoa desberdina da. Drosophila melanoogast-ek ateratako intramolekularekiko disulfidoaren zubia lotzeko modua landare-defentsa peptidoen antzekoa zen. Kristalaren baldintzetan, defentsa peptidoak dimero gisa aurkezten dira.
4.Achyplesin ferradun karramarroetatik eratorria da, Horseshoecrab izenekoa. Konfigurazio azterketek erakusten dute antiparalel B-tolestura konfigurazioa hartzen duela (3-8 posizioak, 11-16 posizioak), zeinetan ban-Gai elkarren artean lotzen da (8-11 posizio), eta bi eta bi lotura-bonuen artean sortzen dira 7 eta 12 posizioen artean, eta 3 eta 16 posizioen artean. Egitura honetan, aminoazido hidrofobikoa hegazkinaren alde batean kokatuta dago, eta sei hondakin katokiko molekularen buztanean agertzen dira, egitura ere biofilikoa da.
Jarraian, ia antimikrobianoen peptido guztiak izaera kationikoak dira, nahiz eta luzera eta altuera aldatu; Amaiera altuan, alfa-heliko moduan edo ban-Gogarria, egitura bitropikoa da ezaugarri arrunta.
Ordua: 03-07-07