Artikulu honetan, oinarrizko aminoazidoen bi, glikora (gly) eta alanine (ALA) sartzen dira. Hau da, batez ere, aminoazido base gisa joka dezaketelako eta taldeei gehitzeak aminoazido mota batzuk sor ditzakeelako.
Glycine-k zapore gozo berezia du, beraz, bere ingelesezko izena Grykys greziarretik (gozoa) dator. Glycine txinatar itzulpenak ez du "gozoa" esanahia izateaz gain, antzeko ahoskera ere badu, "fideltasuna, lorpena eta dotorezia" ereduari deitu diezaiokeena. Zapore gozoa dela eta, glicina elikagaien industrian zaporetsu agente gisa erabiltzen da askotan mingotsa kentzeko eta goxotasuna areagotzeko. Glikoren alboko katea txikia da hidrogeno atomo bakarrarekin. Horrek ezberdina bihurtzen du. Oinarrizko aminoazidoa da, kiralitaterik gabe.
Proteinen glikoina tamaina eta malgutasun txikia da. Adibidez, kolagenoaren hiru hutsetako helix konformazioa oso berezia da. Bi hondakin bakoitzeko gliko bat egon behar da, bestela oztopo gehiegi eragingo du. Era berean, proteina baten bi domeinuaren arteko loturak glicina malgutasun adostasuna eskaintzea eskatzen du. Hala ere, glicina nahikoa malgua bada, bere egonkortasuna nahitaezkoa da nahitaez.
Glycine α-helix eraketa garaian spoilers bat da. Arrazoia da alboko kateak txikiegiak direla batere konformazioa egonkortzeko. Gainera, glikoina maiz erabiltzen da bufferraren irtenbideak prestatzeko. Elektroforesia egiten dutenek askotan gogoratzen dute hori.
Alanine izenaren izena Alemaniako azetaldehidotik dator, eta txinatar izenak errazagoa da ulertzea, Alanine-k hiru karbono dituelako eta bere izen kimikoa alanina da. Izen sinplea da, aminoazidoaren pertsonaia baita. Alaninearen alboko kateak metil talde bakarra du eta glikoarena baino zertxobait handiagoa da. Beste 18 aminoazidoetarako formula estrukturalak marrazten nituenean, taldeak gehitu nituen ALANINEra. Proteinetan, alanina adreilua bezalakoa da, inorekin kontra egiten ez duen oinarrizko eraikuntzako material arrunta.
Alanearen alboko kateak oztopo gutxi du eta α-helix-en kokatuta dago, adostasuna baita. Oso egonkorra da β-tolestuta dagoenean. Proteina ingeniaritzan, aminoazido bat proteina baten gainean xede zehatzik gabe nahastu nahi baduzu, orokorrean alaninarekin mututu dezakezu, eta hori ez da erraza proteinen konformazio orokorra suntsitzea.
Ordua: 02/07-07